Ostaszewska T., Szatkowska I., Verri T., Dabrowski K., Romano A., Barca A., Muszyńska M., Dybus A., Grochowski P., Kamaszewski M. 2009. Клонирование
двух PepT1 кДНК фрагментов
сазана Cyprinus carpio (Actinopterygii: Cypriniformes: Cyprinidae). Acta Ichthyol. Piscat. 39 (2): 81–86.
Background.
Сазан, Cyprinus carpio
является
модельным
организмом
среди Teleostei. Олигопептиды
– новые и
многообещающие
альтернативные
источники
аминокислот
в питании как
животных, так
и человека. У
сазана мембранный
белок, который
транспортирует
олигопептиды
через
мембрану
энтероцита, кодируется
геном PepT1 (SLC15A1).
Цель этой статьи
состояла в секвенировании
PepT1 (SLC 15A1)
сазана.
Materials and methods.
Образцы
кишечников
были
изолированы
от шестинедельных
сазанов. Общая
РНК изолировалась
с использованием
тризола.
Обратная
транскрипция
использовалась
для синтеза кДНК.
Две различные
пары праймеров
были
разработаны,
согласно последовательности
PepT1 дании-рерио
(Danio rerio), и
использовались
для ПЦР. Амплифицированная
ДНК была изолирована
электрофорезом,
клонирована в
pCRII-TOPO векторах, секвенирована
и подвергнута
анализу
in silico.
Results.
Два
нуклеотидных
фрагмента
гена PepT1 были
получены и
проанализированы
методами биоинформатики.
Оба
фрагмента
показали
высокую
степень
гомологии с
известными
генами PepT1 других
костистых рыб,
млекопитающих
и птиц.
Высокая
гомология гена
PepT1 и сходная
первичная
структура
белка среди
вышеупомянутых
таксонов,
вероятно,
отражают
консервативную
функцию
белка PepT1. Оба
фрагмента
гена PepT1 были помещены
в GenBank (FJ556590; FJ529670).
Conclusion.
Секвенированные
фрагменты
гена PepT1 сазана
позволят оценить
транспорт
белка в
кишечниках
рыбы, содержащихся
на диетах с
различными типами
белков, что является
важным моментом,
относящимся к
питанию рыб, и
его значение в
аквакультуре.
Keywords:
Cyprinus carpio, переносчикбелка,
PepT1,
кишечник,
последовательность